Основният режим на работа на системата за радиочестотна идентификация е разделен на пълен дуплекс (Full Duplex) и полудуплекс (Half Duplex) система и последователност (SEQ) система. Пълен дуплекс означава, че радиочестотният етикет и четецът могат да си предават информация едновременно. Полудуплекс означава, че радиочестотният етикет и четецът могат да предават информация в двете посоки, но могат да предават информация само в една посока едновременно.
В системи с пълен дуплекс и полудуплекс отговорът на радиочестотния маркер се изпраща под електромагнитното поле или електромагнитната вълна, излъчвана от четеца. Тъй като в сравнение със сигнала на самия четец, сигналът на радиочестотния етикет е много слаб на приемащата антена, така че трябва да се използва подходящ метод на предаване, за да се различи сигналът на радиочестотния маркер от сигнала на четеца.